这是一个魔法少女的存在获得了认可的世界。一款名为《魔法少女育成计划》的游戏能够万里挑一制造出真正的魔法少女，而等待着这些幸运女孩们的，将会是万人的仰慕和光明的前途。然而，某一日，运营方忽然宣布要将魔法少女的数量削减一半，而方法，竟然是让现存的魔法少女进行残酷的竞赛。天真善良的少女白雪（东山奈央 配音）、外冷内热的忍者波纹（沼仓爱美 配音）、背负着巨剑的圣少女（佐仓绫音 配音）、骑着扫帚大大咧咧的最高速（内山夕实 配音）、百发百中的神枪手灾厄玛丽（井上喜久子 配音），在这些被吉祥物法布（间宫胡桃 配音）选中的魔法少女们之间，一场大战即将拉开序幕。
Netflix续订《降世神通：最后的气宗》第三季。
第一幕「华都花之军」 太正８年的春天，为了应付即将爆发的降魔之战，帝国陆军的米田一基提案组织帝国华击团，而藤枝菖蒲则奉命前往世界各地寻找能够成为队员的超能力者。此时，真宫寺完全不知自己的命运即将改变，仍在故乡仙台持续练习着剑术…。 第二幕「在樱花中展放吧，神剑」 为了保卫帝都不受降魔的侵袭，红兰、玛莉亚、环奈、爱莉丝等四人在总司令_米田的号召下，加入了帝国华击团。然而，等待着他们来挑战的并非军事训练，而是为了能登上「大帝国剧场」的花舞台，所进行的舞蹈及发声练习；原来这是米田为了隐藏帝国华击团的存在而想出的奇特点子。接着，帝国华击团为了补强战力，找来了神崎重工会长的孙女—菫加入阵容，但因为菫的态度非常高傲，使得环奈对她十分不满，好不容易就要建立起来的团队默契，眼看着又陷入了撕裂的危机…。另一方面，真宫寺樱决定前往东京，她在出发前得到了一本记载着真宫寺家祖传的北辰一刀奥义流的书卷，樱是否能领悟出这本奥义中所记载的剑术呢？ 第三幕「春天三月，首次登场」 帝国华击团在经过一番波折后，终于正式开始运作，而花组的成员为了消灭徘徊于帝都的降魔，也展开了一连串的作战。此时，大帝国剧场的舞台揭幕了，用来掩护华击团的另一个身分——「帝国歌剧团」，其公演也陆续开始。樱虽然顺利加入了帝国华击团，但却在驾驶光武的演习中发生失控，导致她只能在舞台边落寞地欣羡玛莉亚等人的演技，此刻花组的其它成员也无法接受樱的加入，队内气氛顿时变得很僵。身兼队长的玛莉亚由于无法负荷每天的密集行程，于是向菖蒲提出了卸下队长职务的要求。某日，玛莉亚在目睹樱独自练习唱歌的情景后，觉得樱拥有很大的潜能，于是决定让她在下次的公演登场，可是菫却对玛莉亚的这项决定感到非常不满，因而大发雷霆…。 第四幕「仲夏梦之夜」 历经数场的战役之后，花组队长大神一郎渐渐地得到其它队员的信赖。不过，大神为了应付这几个非常有个性的队员，每天都费尽了心思，身心的疲惫也因此达到了最高点。某天，当大神在执行夜间巡逻任务时，凑巧看见独自一人在练习剑术的樱，大神对樱说：「我很羡慕你们能够为人们带来梦想」；其实樱最近早就觉得大神很没精神，在听到这番话之后，为了激励大神，于是反过头来要求他企划一场由花组全体登台表演的歌剧。这场由大神负责指挥的歌剧是否能顺利演出呢？
